自慰 白虎 科研报说念| HiTIP
以下著作开首于hLife Journal 自慰 白虎,作家陈忠尧、胡亚伟等
自慰 白虎
hLife Journal .
hLife竭力于促进基础照看与临床诈欺会通发展。
实足性中线胶质瘤(Diffuse Midline Glioma, DMG)是一种儿童型实足性高档别胶质瘤,以H3K27更动为表不雅遗传学特征,好发于青少年儿童群体。由于肿瘤位于核心神经系统核心功能的“中轴线”区域,如:桥脑、丘脑和脊髓等,使得其手术风险极高;与此同期,肿瘤具有高度恶性增殖、侵袭与飘零的生物学特征,患者预后极差。多年以来,国外上开阔以手术/活检术市欢放化疗为传总揽疗面貌,未能给此类患者带来显耀临床获益,多量患者在确诊后一年傍边死亡。刻下,人人鸿沟穷乏行之灵验的调节计谋。
近日,清华大学生物医学工程学院刘鹏照看团队辘集清华大学临床医学院章薇照看团队在hLife上发表题为“HiTIP-seq profiles epigenomic reprogramming of patient-derived diffuse midline glioma stem cells to epigenetic therapy”的封面著作(图1)。
图1 hLife 2024年第九期封面
该照看基于微阵列芯片设立出一种高通量原位标志免疫千里淀测序时候(HiTIP-seq),不仅为DMG照看提供了新时候,更为其调节新计谋提供了科学依据(图2)。
图2 高通量原位表不雅组学分析时候HiTIP-seq
DMG最常见的分子特征是组卵白H3第27位赖氨酸突变为甲硫氨酸(H3K27M),这一突变所致的表不雅遗传十分进而初始肿瘤的恶性推崇。关系照看标明,表不雅遗传药物能通过对DMG肿瘤细胞的组卵白修饰重编程来阻挡与肿瘤推崇关系的基因抒发。然则,由于DMG好发部位的手术高风险性,肿瘤样本的稀缺性,以及构建体外细胞培养体系的时效性,均进击了该范畴机制照看与转换调节的实验性推崇。
基于此,照看团队设立了一种基于微阵列芯片的高通量原位标志免疫千里淀测序时候——HiTIP-seq。与传统的染色质免疫千里淀测序时候(ChIP-seq)比较,HiTIP-seq不错高通量地从极少细胞样本中赢得较高质地的表不雅组学修饰信息,这一转换时候为 DMG 等以表不雅遗传十分初始的疾病照看和转换诊疗提供了核心时候支援(图3)。
图3 HiTIP-seq在不雷同本肇熟察下分析H3K4me3和H3K27ac修饰的贤达度和特异性
著作照看标明,表不雅药物Panobinostat和Tazemetostat的组合不错通过对肿瘤细胞的组卵白修饰重编程,阻挡与肿瘤推崇关系的基因抒发。通过HiTIP-seq时候,照看东说念主员对来自DMG患者肿瘤干细胞的表不雅修饰更动进行了深切分析,揭示了这两种药物通过升高H3K27乙酰化(H3K27ac)和缩短H3K27三甲基化(H3K27me3)修饰水平来灵验阻挡肿瘤细胞的助长。
此外,通过辘集转录组测序分析(RNA-seq)发现,Panobinostat和Tazemetostat的联用调控了Wnt信号通路阻挡因子WIF1的激活,阻挡了肿瘤细胞的增殖。这一发现为DMG反应表不雅遗传疗法提供了科学依据(图4)。
图4 Wnt阻挡因子1(WIF1)的抒发调控对DMG肿瘤细胞增殖的影响
要而论之,HiTIP-seq约略从极少样本中赢得高质地表不雅组学修饰信息,并市欢高通量微阵列芯俄顷候,兑现种种本和多药物组合的同步分析。这一毒害为实足性中线胶质瘤的照看和调节拓荒了新路线,为DMG患者的临床获益带来了新但愿。同期,HiTIP-seq也为其他癌症的表不雅遗传照看提供了强有劲的器用,有望进一步激动癌症转换诊疗范畴的新推崇。
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作家简介
陈忠尧
助理照看员
第一作家
机构:清华大学生物医学工程学院
照看倡导:基于微流控芯俄顷候和类器官模子酌量肿瘤的致病机理和调节计谋
色戒在线
高强
博士照看生
第一作家
机构:清华大学临床医学院、清华-IDG/麦戈文脑科学照看院
照看倡导:实足性中线胶质瘤发病机制及调节
刘鹏
照看员
通信作家
机构:清华大学生物医学工程学院、昌平实验室
照看倡导:分子会诊的集成化自动化与细胞筛选的微量化万能化
章薇
照看员
副主任医生
通信作家
机构:清华大学临床医学院、清华-IDG/麦戈文脑科学照看院、国度儿童医学中心/齐门医科大学附属北京儿童病院、清华大学附属北京清华长庚病院
照看倡导:核心神经系统恶性肿瘤个体化精确诊疗
胡亚伟
助理照看员
通信作家
机构:昌平国度实验室
照看倡导:以类器官为体外模子的免疫调节
援用纪律:
Chen Z, Gao Q, Shang Y, et al. HiTIP-seq profiles epigenomic reprogramming of patient-derived diffuse midline glioma stem cells to epigenetic therapy. hLife.
https://doi.org/10.1016/j.hlife.2024.07.004.
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